Retour sur le passé de Naruto : nous voici deux ans après la désertion de Sasuke. Tsunade, qui sait qu’Akatsuki manœuvre dans l’ombre pour s’emparer des Bijûs, décide de tendre un piège à l’organisation criminelle en organisant un nouvel examen de sélection à Konoha et à Suna. Mais elle ignore si les autres Kage se prêteront à ce jeu audacieux...