La squadra indaga sull'omicidio di una donna che viene portato da un marinaio alla corte marziale. Il caso porterà Tony al suo vecchio ufficio di Baltimora. Nel frattempo Bishop, vedendo il cambiamento del marito, dopo essere scampato all'attentato a Dubai, crede che sia indagato per una fuga di notizie all'interno dell'NSA. Jake confessa poi di essere cambiato perché ha una relazione. Bishop profondamente turbata e ferita decide di lasciare il team per fare ritorno a casa sua, in Oklahoma.