Elder's Tale è il MMORPG fantasy più famoso e popolare al mondo, con milioni di giocatori. Ma con la undicesima espansione distribuita, Novasphere Pioneers, per motivi sconosciuti 36.000 giocatori collegati al server giapponese, più altre centinaia provenienti dal resto del mondo, si trovano improvvisamente trasportati all'interno del gioco e "indossano" i loro avatar come se fossero i loro veri corpi. Il gioco diventa così la loro nuova realtà, essendo intrappolati nel mondo virtuale senza la possibilità di eseguire il log out. Shiroe, un giocatore socialmente schivo, assieme agli amici Naotsugu e Akatsuki decide di fondare una nuova gilda chiamata "Log Horizon" per sopravvivere nel nuovo mondo.