Nonostante il recente attacco di Akuma, i membri dell'Ordine Nero sono di buon umore e si accingono a trasferirsi in una nuova base. Subito dopo il suo arrivo, però, Allen Walker viene improvvisamente chiamato dall'Agenzia Centrale e si vede sigillare il braccio con la forza dall'Ordine. Viene quindi condotto ad un sorprendente incontro con il suo maestro, il generale Cross Marian, che gli rivela sconcertanti segreti che circondano l'enigmatico 14° Noah. Un incidente con un ladro fantasma, l'arrivo di un misterioso gruppo di Esorcisti, la morte di un importante compagno e una battaglia totale contro la Famiglia Noah: cosa significa tutto questo per Allen, Yuu Kanda e il resto dell'Ordine? Questo è solo l'inizio di una serie di strani eventi apparentemente scollegati che portano a qualcosa di molto più grande.