Il malinconico e immotivato Kiyotaka Ayanokouji frequenta il suo primo giorno alla Tokyo Metropoiltan Advanced Nurturing High School, un'istituzione stabilita dal governo per formare una generazione dei migliori e più brillanti giapponesi. In questa scuola, si dice, tutto si decide in base al merito, compresa la generosa indennità mensile di "punti" che gli studenti possono spendere nei negozi locali. Quando Ayanokouji inizia a navigare in questo sistema, coltiva anche curiose relazioni con l'estranea Suzune Horikita e il gregario Kikyou Kushida.