A série se passa em meio ao filme original, no período em que Hércules está sob o treinamento de Filoctetes. Zeus, pai do herói, decide inscrevê-lo na Academia Prometeu, uma escola para deuses e mortais. Lá faz amizade com Ícaro, um garoto que enlouqueceu após voar próximo demais do Sol, e Cassandra, uma vidente sarcástica pelo qual Ícaro é apaixonado, e e cria rivalidade com o vaidoso Adônis. No meio-tempo, exercita seu treinamento, tenta impedir Hades de tomar posse do Olimpo, e encontra muitos mitos gregos.