Otwierający sezon drugi, „Czerwony deszcz”, kontynuuje akcję z finału poprzedniego sezonu, kiedy Anna uwolniła Czerwone Niebo na planecie. Czy w świecie na krawędzi wojny i chaosu znajdzie się ktoś, kto może przeciwstawić się Annie? W międzyczasie Ryan był przetrzymywany w izolacji na statku-matce, z dala od swojego hybrydowego dziecka, aby Anna mogła na niej eksperymentować; Chad, szukając odkupienia za to, że został wykorzystany przez Annę, chce teraz walczyć z Piątą Kolumną; a Erica wyrusza w podróż, aby znaleźć naukowca, który może udzielić jej odpowiedzi na pytanie, czym jest Czerwone Niebo i gdzie poznaje przerażającą tajemnicę tego, co V robią na naszej planecie.